No mesmo dia 16, Hidalgo e seus homens deixaram Dolores, marchando para San Miguel el Grande, e ao entardecer entraram na cidade.
Ali se juntaram a eles o Regimento da Rainha e no caminho uma multidão de camponeses, principalmente índios, armados de flechas, paus, fundas e instrumentos agrícolas, sem ordem, sem disciplina, seguindo seus capitães das fazendas como chefes. ; montavam a cavalaria em cavalos magros e maus, os cavaleiros com poucas lanças e as espadas e facões típicos de suas ocupações rurais. Aquelas pessoas marchavam seguindo um forte instinto que o movia e que ele não sabia definir, mas não tinha bandeira; Ao passar por Atotonilco, Hidalgo encontrou uma imagem de Nossa Senhora de Guadalupe, a fez suspender no cabo de uma lança, e esse era o estandarte do exército: em todas as inscrições foi colocado um carimbo do simulacro sagrado, e os apoiadores o usavam para crachá no chapéu. As inscrições colocadas ao lado da imagem eram: “Viva a religião. Viva nossa Santíssima Mãe de Guadalupe. Viva Fernando VII. Viva a América e o mau governo morre. "
Os insurgentes, agarrando a pessoa dos espanhóis e saqueando suas casas, passaram por Chamacuero e entraram em Celaya no dia 21. Até então a revolução não tinha líder; Na verdade, os caudilhos que o promoveram eram, e por deferência à idade, conhecimento e caráter de sacerdote, Hidalgo representava o primeiro lugar; para dar legalidade ao fato, no dia 22, com o auxílio da Prefeitura de Celaya, foi nomeado Hidalgo, general; Allende, tenente-general; então ele foi investido com o comando supremo, por consentimento unânime. O exército então contava com cerca de 50.000 homens e vira várias companhias de provinciais da cidade passarem às suas fileiras. Com essas forças avançaram sobre Guanajuato, e no dia 28 a cidade caiu em suas mãos, após um combate sangrento na Alhóndiga de Granaditas, cujos defensores morreram após serem esfaqueados.
Depois dos primeiros dias, e com eles a confusão, Hidalgo se dedicou a organizar a Câmara Municipal, nomeou funcionários, tratou de fundar uma fundição de canhões, uma Casa da Moeda, e se dedicou o mais rápido que pôde para aproveitar sua conquista. Enquanto isso, o governo se preparou para lutar contra a revolução. O bispo eleito de Michoacán, Abad y Queipo, publicou um édito em 24 de setembro declarando excomungados Hidalgo, Allende, Aldama e Abasolo.
O exército seguiu para Maravatío, Tepetongo, Hacienda de la Jorda, Ixtlahuaca e Toluca, e em 30 de outubro derrotou as forças de Torcuato Trujillo, comandadas pelo vice-rei Venegas para contê-lo, no Monte de las Cruces. Com esta vitória o caminho para a capital foi aberto; Allende era da opinião de que avançar sobre ela correria o risco de um golpe decisivo; Hidalgo se opôs, alegando a falta de munições, as perdas sofridas na batalha, que incutiu grande terror nos jovens, a aproximação das tropas monarquistas sob o comando de Calleja e o duvidoso sucesso de um combate contra a guarnição não desprezível do cidade. Sem fazer nada, ficaram às portas do México até 1º de novembro e no dia 2 de novembro começaram a voltar por onde haviam vindo, com a intenção de ir agarrar Querétaro.
O primeiro mal, resultado do retrocesso, foi perder metade do povo para a deserção. Os insurgentes desconheciam a direção que o exército monarquista estava tomando e as operações que havia realizado; A notícia de sua aproximação foi ouvida por dispersos de um grupo, que encontrou o inimigo descoberto na fazenda Arroyozarco. A batalha já era inevitável; Apesar das baixas, os insurgentes somavam mais de quarenta mil homens, com doze peças de artilharia, e tomaram posição na colina quase retangular que se estende da cidade até a colina de Aculco. Na madrugada de 7 de novembro eles foram atacados e completamente dispersos sem lutar, deixando suas bagagens e ferramentas de guerra no campo. Allende se aposentou por Guanajuato; Hidalgo entrou em Valladolid com cinco ou seis pessoas; as numerosas forças reunidas pouco antes disso haviam diminuído. O objetivo da separação dos dois chefes era colocar Guanajuato em estado de defesa, enquanto novos homens eram recrutados, a artilharia era derretida e divisões eram organizadas para atacar os vencedores simultaneamente.
Em 15 de novembro, Allende participou de sua resolução, e no dia 17 deixou Valladolid com sete mil cavaleiros e duzentos e quarenta soldados de infantaria, todos mal armados, entrando em Guadalajara no dia 26. Allende, que viu Calleja se aproximando com seu exército, atacando facilmente as cidades em seu caminho, em 19 de novembro condenou a marcha de seu companheiro e escreveu que em vez de sair pensando em sua segurança pessoal, pense na de tudo, e venha com suas tropas para ajudar a praça, em combinação com outros jogos: no dia 20 ele repetiu outra carta do mesmo tenor. Como Guanajuato foi perdido em 25 de novembro, a retirada não trazia mais nenhum benefício.
Depois que os monarquistas tomaram Guanajuato, Allende marchou para Zacatecas e de lá para Guadalajara, onde entrou no dia 12 de dezembro, Valladolid perdeu suas forças e as autoridades também se retiraram para aquela praça, que se tornou o foco da revolução. Tentou-se então estabelecer um governo presidido por Hidalgo, com dois ministros, um da "Graça e Justiça" e outro denominado "Secretário de Estado e Gabinete", mas não funcionou.
Allende opinou, assumindo que a batalha era inevitável, pois a tropa organizada com a artilharia útil foi levada a campo, para que em caso de revés o grosso do exército permanecesse de pé, enquanto pudesse ser instruído, deixando uma retirada segura e uma ponta de apoio na cidade; Hidalgo opinou em contrário, sendo os votos do conselho por ele decididos. Conseqüentemente, o exército composto por cerca de cem mil homens, com vinte mil cavaleiros e noventa e cinco canhões, deixou a cidade em 14 de janeiro de 1811 para acampar nas planícies da ponte de Guadalajara, e no dia 15 para assumir um posto militar em a ponte de Calderón, local escolhido por Allende e Abasolo. Os insurgentes foram derrotados e o exército dispersado.
